《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:郭梓杰, 王俊波, 刘强, 王璞, 张刚, 海梅梅, 王元文, 张思浓, 李勇
单位:1.宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,银川 7500212.宁夏大学生命科学学院,银川 750021
摘要:目的 利用免疫信息学方法,设计一种针对牛呼吸道合胞体病毒(Bovine respiratory syncytial virus,BRSV)F和G蛋白的多表位疫苗,以期有效激活T细胞和B细胞免疫应答。 方法 基于F和G蛋白的抗原序列,综合考虑各表位的抗原性、过敏性、毒性等参数,使用生物信息学分析软件筛选出抗原的B细胞表位、细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位和辅助性T淋巴细胞(HTL)表位;筛选后的B细胞表位、CTL表位和HTL表位分别使用KK、AAY、GPGPG Linker进行连接;基于表位的连接,从构建的序列N-端添加一段β-防御素肽3的佐剂,在C-端添加6×His标签;采用计算方法对所构建的疫苗蛋白序列与Toll样受体3(TLR3)和TLR4进行蛋白-蛋白分子对接,选择聚类最大的对接结果进行分子动力学(MD)模拟,并通过计算机进行免疫模拟、密码子优化和计算机克隆。 结果 从F和G抗原中共筛选出5个B细胞表位、7个CTL表位和4个HTL表位;疫苗构建体与TLR3和TLR4的模型分别在整个模拟期间具有良好的亲和力和稳定性;对疫苗进行免疫模拟分析,证明该疫苗不但能显著诱导IgG、IgM等各种抗体的产生,而且还提高了各种细胞因子的含量。通过密码子优化,疫苗GC含量为49.25%,密码子适应指数(CAI)达到1,证明该疫苗具有在原核表达系统中高效表达的潜力,将该疫苗嵌入原核表达载体pET-28a(+)的BamHⅠ和XhoⅠ限制性酶切位点中,生成一个完整的克隆构建体,序列长度为930 bp。 结论 本研究设计的多表位疫苗具有诱导强烈的T细胞和B细胞反应的潜能,为BRSV多表位疫苗的研制提供了一定的理论依据与数据支持。
关键词:牛呼吸道合胞体病毒(BRSV);F蛋白;G蛋白;B细胞表位;CTL表位;HTL表位
基金资助:肉牛重要传染病新型诊断与疫苗关键技术研究与应用(2024BBF02017)