基于转录组测序筛选鸡gga-miR-1696的潜在靶基因

来源：中国畜牧兽医杂志2026年第3期北京时间：

作者：张红红, 潘新怡, 卓处文, 戴国俊, 张涛, 张跟喜

单位：1.扬州大学动物科学与技术学院，扬州 2250092.江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室，扬州 225009

摘要：目的 本研究旨在通过转录组测序技术筛选gga-miR-1696的潜在靶基因，以期揭示其调控鸡骨骼肌发育的分子网络，为阐明gga-miR-1696的功能机制提供理论依据。 方法 以鸡成肌细胞为研究对象，分别转染gga-miR-1696 mimic（过表达组）和gga-miR-1696 mimic NC（对照组）进行转录组测序分析，筛选组间的差异表达基因（DEGs），并对DEGs进行功能富集分析。随机选取6个DEGs进行实时荧光定量PCR验证。 结果 转录组测序结果显示，共获取39.36 Gb的高质量质控数据，每个样本的数据量均超过6.10 Gb，且Q20达到98.9%以上，Q30达到95.0%以上。过表达组与对照组共筛选到568个DEGs，其中248个显著上调，320个显著下调。GO功能富集分析发现，靶基因主要参与细胞分解代谢过程、生物黏附性、动物器官发育过程等条目。KEGG通路富集分析显示，靶基因显著富集在血管平滑肌收缩、肌动蛋白细胞骨架、MAPK信号通路等。6个DEGs的实时荧光定量PCR结果与转录组测序结果一致。 结论 预测结果表明，COL1A1、THBS4和EGFR等基因可能在鸡骨骼肌发育中发挥关键作用，且EGFR可能是gga-miR-1696的靶基因，可用于后续功能验证，以揭示gga-miR-1696通过调控EGFR基因影响鸡骨骼肌生长发育的机制。

关键词：鸡;骨骼肌发育;gga-miR-1696;转录组测序;功能富集

基金资助：国家肉鸡产业技术体系建设项目(CARS-41);江苏省高校优势学科建设工程（PAPD）