lnc-88672通过ceRNA靶向MyoZ2基因调控猪肌纤维类型转化的分子网络分析

来源：中国畜牧兽医杂志2026年第3期北京时间：

作者：赵建华, 刘宏, 秦世斌, 刘清, 曹果清, 郭晓红, 李步高, 高鹏飞

单位：1.大同市农业种质资源保护试验中心，大同 0370002.山西农业大学，太谷 030801

摘要：目的 长链非编码RNA（lncRNA）作为竞争性内源RNA（ceRNA）在肌肉发育调控中发挥着重要作用。本研究旨在解析lnc-88672在猪肌肉发育中的分子调控网络及其潜在的作用机制，为深入探究猪肌肉发育的遗传调控机制提供参考。 方法 通过生物信息学分析筛选lnc-88672具有结合能力的微小RNA（miRNA），预测靶基因，并进行GO功能和KEGG通路富集分析，以及构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。采集1日龄大白猪仔猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、结肠、腰大肌、股二头肌、背最长肌等组织，采用实时荧光定量PCR检测lnc-88672的组织表达谱；采集不同发育阶段（1、90、180日龄）马身猪和大白猪背最长肌组织，检验lnc-88672及其靶基因的表达水平，并分析表达相关性。 结果 lnc-88672与肌原调节蛋白2（MyoZ2）基因部分序列重合。lnc-88672可与miR-8073、miR-221-5p、miR-7106-5p等10个miRNA结合，共调控5 599个靶基因的表达。通过GO功能和KEGG通路富集分析，构建了lnc-88672-miRNA-mRNA三元调控网络，包括蛋白质结合、ATP结合、转录因子活性、G蛋白偶联受体活性及肌动蛋白调节5个生物学功能模块。lnc-88672在大白猪多种组织中均有表达，在腰大肌、股二头肌和背最长肌等肌肉组织中表达量较高，极显著高于其他组织（P<0.01），表现出明显的肌肉组织偏好性。在马身猪和大白猪发育过程中，lnc-88672在1日龄时表达量最高，90日龄时表达量明显下降，180日龄时表达量出现升高趋势。相关性分析结果显示，lnc-88672与MyoD2（r=0.97）、HDAC5（r=0.84）、HP1BP3（r=0.81）等22个基因的表达量呈显著正相关（P<0.05），与AHDC1（r=―0.74）、SAMD4A（r=―0.73）、SETD7（r=―0.70）等5个基因的表达量呈显著负相关（P<0.05）。 结论 lnc-88672具有分子海绵作用机制，可通过吸附miR-766-5p/miR-7106-5p，解除其对MyoZ2基因的抑制，从而激活CaN/NFAT信号通路，促进慢肌纤维生成，改善猪肉品质。

关键词：猪;lnc-88672;MyoZ2基因')">MyoZ2基因;ceRNA;肌纤维类型

基金资助：山西省自然科学基金(202203021211268)