2016—2024年云南省PRRSV分子流行病学调查及ORF5基因遗传进化分析

来源：中国畜牧兽医杂志2026年第6期北京时间：

作者：杨红敏, 段博芳, 杨佳, 唐永春, 杨绍红, 和塍, 李素华, 尹红斌

单位：1.西南林业大学生物与食品工程学院，昆明 6502242.云南省动物疫病预防控制中心，昆明 6502013.香格里拉市农业农村局动物卫生监督所，迪庆 6744004.怒江州动物疫病预防控制中心，怒江 673200

摘要：目的 了解云南省猪繁殖与呼吸综合征病毒（Porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV）的流行情况和遗传变异特征，为云南省PRRSV的防控提供理论依据。 方法 2016-2024年，从云南16个州市采集13 803份样品，通过实时荧光定量PCR扩增ORF7基因以鉴定PRRSV阳性样品，采用全局与局部空间自相关分析，解析病毒的时空分布特征，通过RT-PCR扩增369份阳性样本的ORF5基因，对筛选获得的部分代表性毒株序列及从NCBI中获取的8条云南分离株ORF5基因序列进行遗传进化、序列相似性、编码氨基酸的变异特征和N-糖基化位点分析。 结果 2016-2024年云南省PRRSV阳性率为2.67%（369/13 803）。全局空间自相关分析显示，云南省PRRSV阳性率随机分布；局部空间自相关分析显示，PRRSV显著聚集区域呈动态变化。基于ORF5基因的遗传进化分析表明，筛选获得的16株代表毒株及8株云南分离株均属于PRRSV-2型，聚类为谱系8（15株）、谱系1（4株）、谱系3（3株）和谱系5（2株）；24株PRRSV毒株核苷酸序列相似性为80.5%~99.7%，氨基酸序列相似性为75.8%~99.5%。氨基酸突变分析表明，诱骗表位区在谱系1、3、5毒株呈V27A、L28P、V29A及N30S突变；中和抗原表位区在谱系1、3、8毒株呈H38Y、L39V/S/I突变；13个毒株具有R13和R151毒力位点。此外，谱系1在第30-32、32-34、33-35和57-59位氨基酸处增加了N-糖基化位点，第51-53位氨基酸处缺失NGT；谱系8在第33-35、34-36位氨基酸处增加了N-糖基化位点，第35-37和44-46位氨基酸缺失NSS和NLT。 结论 2016—2024年云南省PRRSV阳性率<10%，全局空间分布随机且局部聚集区动态变迁。流行毒株呈现多谱系共存，以谱系8为主要流行谱系。ORF5基因氨基酸位点和N-糖基化位点存在不同程度变异。必须加强持续性流行病学监测，并实施更具针对性的防控与预警措施。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）;ORF5基因')">ORF5基因;GP5蛋白;遗传进化;空间自相关

基金资助：云南省科学技术厅创新引导与科技型企业培育计划(202404BI09004)