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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:田进理, 罗园丽, 赵薇, 蔡正云, 张本轩, 顾亚玲, 张娟
单位:1.宁夏大学动物科技学院,银川 7500212.宁夏凤集生态农业科技有限公司,固原 756000
摘要:目的 筛选调控静原鸡肌苷酸(inosine monophosphate,IMP)沉积的关键长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)及其靶基因,并验证候选基因在静原鸡成肌细胞中的功能。 方法 基于前期静原鸡胸肌、腿肌转录组数据,通过生物信息学方法分析差异表达lncRNA并预测其靶基因,进一步对其进行GO功能和KEGG通路富集分析;选取关键候选基因后,构建过表达载体和siRNA干扰载体,转染成肌细胞后探究其对细胞增殖、分化和凋亡的影响。 结果 转录组数据分析共鉴定出163个差异表达lncRNA,预测到37个潜在靶基因。GO功能和KEGG通路富集分析显示,靶基因显著富集于脂肪酸降解、PPAR信号通路、糖酵解/糖异生等代谢途径。筛选出关键候选基因ACSL1,成功构建其过表达载体和干扰载体。细胞转染试验显示,与对照组相比,过表达ACSL1基因后成肌细胞增殖标志基因细胞周期蛋白E(Cyclin E)、增殖细胞核抗原(PCNA)等以及分化标志基因肌细胞生成素(MyoG)、肌原性分化1(MyoD1)等表达上调(P<0.05),EDU阳性细胞比例升高,成肌细胞凋亡标志基因BCL2颉颃因子1(BAK1)、BH3相互作用域死亡激动剂(BID)等表达下调(P<0.01),凋亡细胞比例降低;干扰ACSL1基因表达则呈现相反趋势。 结论 ACSL1基因作为lncRNA与脂质代谢的枢纽,通过促进成肌细胞增殖分化并抑制凋亡,正向调控肌肉发育与IMP沉积。本试验结果为深入研究静原鸡IMP沉积提供了参考依据。
关键词:静原鸡;肌苷酸;lncRNA;ACSL1基因')">ACSL1基因;成肌细胞
基金资助:宁夏自治区自然科学基金(2023AAC03102);2022年自治区青年拔尖人才培养项目;宁夏禽蛋产业首席专家团队项目