《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

梅花鹿产茸性状的全基因组关联分析

来源:中国畜牧兽医杂志2026年第6期北京时间:

作者:陈国福, 张梦幻, 佟玲, 葛爱有, 陈保君, 赵列平, 张震

单位:黑龙江省农垦科学院,哈尔滨 150038

摘要:目的 本研究基于全基因组重测序(whole genome resequencing,WGR)技术对梅花鹿产茸性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),以挖掘梅花鹿产茸性状的候选基因,为实现高产茸量个体的早期精准筛选与定向选育提供理论基础。 方法 采集266只产茸时期梅花鹿的血样并提取DNA,通过DNBSEQ-T7测序平台进行WGR,使用GEMMA软件的混合线性模型对产茸性状进行GWAS。利用ANNOVAR软件对关联的单核苷酸多态性(SNP)位点进行注释,进一步通过PCR扩增进行检测。 结果 梅花鹿血样WGR共获得60 317 854个SNPs位点,通过GWAS共检测到67个与产茸性状显著关联的SNPs位点(P<1×10―6)。结合基因功能注释结果,进一步选取3个SNPs位点,对其对应的基因(COMT1、FMNL2及CRYM)进行PCR检测,结果显示,上述基因内部所含的与产茸性状关联的SNP位点均存在多态性。 结论 本研究基于WGR数据,通过GWAS共筛选获得67个与梅花鹿产茸性状潜在相关的SNPs位点,其中筛选到的COMT1、FMNL2及CRYM可能是影响产茸性状的重要候选基因,这些候选基因可作为分子标记辅助育种的潜在靶点,为解析梅花鹿产茸性状的遗传基础提供了有效分子标记。

关键词:梅花鹿;产茸性状;全基因组重测序(WGR);全基因组关联分析(GWAS)

基金资助:北大荒种业创新与发展项目“梅花鹿产茸性状相关分子标记开发与利用研究”(2022ZY0102-02-02)

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