贵阳地区猪德尔塔冠状病毒的分离鉴定及其S基因生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2026年第7期北京时间：

作者：黄布敏, 张晓霞, 张人俊, 陈念, 杨琳, 王柏林

单位：1.开阳县养殖业发展服务中心，开阳 5503002.甘肃农业大学动物医学院，兰州 7300703.兰州海关技术中心，兰州 7300104.贵州省动物疫病预防控制中心，贵阳 550000

摘要：目的 掌握贵阳地区猪场腹泻主要病原的流行现状，为猪群腹泻防控提供科学依据。 方法 2024年12月至2025年3月采集贵阳市10个规模化猪场的112份腹泻粪便样本，采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus， PEDV）、猪传染性胃肠炎病毒（Transmissible gastroenteritis virus， TGEV）、猪德尔塔冠状病毒（Porcine deltacoronavirus， PDCoV）、猪轮状病毒（Porcine rotavirus， PoRV）进行检测。对PDCoV阳性样本进行病毒分离，并对其S基因进行遗传进化与生物信息学分析。 结果 病原检测结果显示，PEDV与TGEV均为阴性；PDCoV阳性率为59.82%（67/112），PoRV阳性率为33.04%（37/112），PDCoV与PoRV混合感染率为16.07%（18/112）。将PDCoV阳性样本接种于LLC-PK1细胞，细胞产生典型病变症状；间接免疫荧光试验结果显示，细胞出现绿色荧光。成功分离到1株PDCoV，命名为GZGY/202504。遗传进化分析表明，该毒株S基因与CHN-HeN06-2022的相似性为99.0%，而与HKU15-155及疫苗株CHN-HN-2014的相似性分别为97.5%和97.1%，属于GⅡ分支（中国谱系），提示该毒株已发生一定变异。与疫苗株CHN-HN-2014 S蛋白氨基酸序列比对，GZGY/202504 S蛋白存在27个位点变异，糖基化、磷酸化修饰潜在位点分别有25和37个，S蛋白三级结构及抗原表位发生改变。 结论 贵阳地区猪场腹泻病原以PDCoV和PoRV为主，且混合感染率较高，本研究成功分离到1株PDCoV，其S蛋白存在“突变-构象-表位”级联变化。研究结果为该地区猪腹泻流行病学调查与防控提供了数据支撑，也为PDCoV感染机制研究及疫苗开发奠定了基础。

关键词：猪德尔塔冠状病毒（PDCoV）;分离鉴定;S基因')">S基因;生物信息学分析

基金资助：黔科合支撑（［2021］一般163、［2020］1Y037）;海关总署科研项目(2024HK068)