纳米孔测序技术应用于食品微生物检测的可行性分析

来源：中国生物工程杂志2018年第12期北京时间：

作者：曹必溥,缪丽华,郭宝颜,贺丽苹

单位：1 广州广检质量检测研究院有限公司 广州 510000","2 华南农业大学测试中心 广州 510642

摘要：近些年来DNA测序技术发展迅速,已经从第一代生化测序发展到第三代单分子测序。作为第三代测序技术中的一种不同于当前流行的其他测序技术,纳米孔测序技术是基于电信号的一种物理方法测序。许多研究者通常将高通量测序技术应用于食品微生物的研究,但是将纳米孔测序技术应用于食品中微生物的检测却鲜有报道。Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技公司)研发的DNA测序仪MinION,是世界首例用于商业测序的纳米孔测序仪,经过不断完善,近年来MinION在DNA测序中被广泛应用。MinION 测序一次需要的DNA量约1μg,其标准识别速度为一秒钟识别250个碱基,平均读长可至13kb~20kb,测序准确率可以达到98%。纳米孔测序的高识别速度和高准确率,完全满足快速检测的要求,将其应用于食品中微生物检测是完全可行的。

关键词：纳米孔测序,DNA测序技术,食品微生物