《中国生物工程杂志》发表论文赏析
作者:罗嘉, 沈林園, 李强, 李学伟, 张顺华, 朱砺
单位:1 四川农业大学动物科技学院 成都 611130;2 四川省畜牧总站 成都 610041
摘要:RNA编辑是RNA转录过程中序列变化而引起的一种基因动态调控机制。腺苷脱氨酶(adenosine deaminases acting on RNA, ADAR)参与RNA编辑,将双链RNA中腺苷残基(A)转化为肌苷(I),接着被转录和拼接成鸟苷(G)。由ADAR催化,作用于RNA的A-I型RNA编辑是人类最常见的转录后修饰。近年来,这种修饰不仅存在于编码RNA中,在非编码RNA(noncoding RNA, ncRNA)中也逐渐被发现,如microRNA(miRNA)、小分子干扰RNA(siRNA)、转运RNA(tRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)。这种修饰可能通过对microRNA和mRNA之间结合位点创造或破坏,进而影响ncRNA的生物起源、稳定性和靶向识别功能。目前,对这种生物现象的机制及ADAR底物,尤其是在ncRNA中的特性仍然没有得到充分的认识。主要对哺乳动物中ncRNA上的RNA编辑进行总结,并列举一些阐明其生物学功能的计算方法。
关键词:RNA编辑,非编码RNA,microRNA,RNA-seq
基金资助:国家科技支撑计划项目(2015BAD03B01-11),国家星火计划项目(2015GA810001),教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT13083),四川省科技富民强县专项计划项目资助项目