《中国生物工程杂志》发表论文赏析

炭样小单孢菌中抗生素生物合成相关蛋白的筛选

来源:中国生物工程杂志2016年第7期北京时间:

作者:陈娟, 杨慧林, 黄运红, 龙中儿

单位:江西师范大学生命科学学院 南昌 330022

摘要:目的:筛选一株具有广谱抗菌活性的炭样小单孢菌JXNU-1中核苷类抗生素生物合成相关蛋白。方法:通过iTRAQ定量蛋白质组学技术对JXNU-1菌体生长期(36h)和产物合成期(108h)的差异蛋白进行鉴定和功能分析。结果:基于iTRAQ定量蛋白质组学技术共鉴定出炭样小单孢菌总蛋白质2390个,差异表达蛋白172个,在产物合成期(108h)表达上调76个、表达下调96个。通过蛋白GO和COG注释等功能分析,筛选出12个与抗生素合成密切相关蛋白和5个生物合成基因簇。结论:利用iTRAQ技术筛选出炭样小单孢菌JXNU-1的抗生素合成相关蛋白,为阐明该抗生素的生物合成机制奠定实验依据。

关键词:炭样小单孢菌,蛋白质组学,抗生素,生物合成途径,基因簇

基金资助:国家自然科学基金(31160029,31360018),江西省自然科学基金(20132BAB204007,20161BAB204174)资助项目

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