《中国生物工程杂志》发表论文赏析
作者:张心愿, 邓佳, 刘馨, 陈琳, 林峻, 蔡伟文
单位:1 福州大学应用基因组学研究所 福州 350108;2 福州大学生物科学与工程学院 福州 350108
摘要:Bst DNA聚合酶大片段作为一种常用的DNA聚合酶,因其独特的特点:能引发链置换反应、高保真、耐高温等,而成为一种重要的DNA多重置换扩增酶。目的:为减少成本,设计一种高产,方便且扩增活性高的Bst DNA聚合酶大片段表达体系;探究该酶应用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增条件。方法:采用pTWIN1质粒作为载体克隆表达Bst DNA聚合酶大片段,应用几丁质亲和层析柱纯化该酶,使用该酶对人类基因组DNA进行不同温度下扩增,探究其最适反应温度,并据此对胃癌石蜡包埋组织基因组DNA进行扩增。结果:由此得到的Bst DNA聚合酶大片段能运用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增,扩增效率可达200倍,并能应用于aCGH芯片。结论:扩增得到保真性高,覆盖基因组范围大的DNA扩增产物。该应用与aCGH结合,使得对少量的癌症石蜡包埋组织DNA样本进行全基因组扩增,并进行其基因拷贝数变异研究成为可能。
关键词:Bst,DNA聚合酶大片段,多重置换扩增,石蜡包埋组织,全基因组扩增
基金资助:国家自然科学基金(31371287,31301537,31571300),福建省科技重大专项(2013YZ0002-1,2013YZ0002-2)资助项目