肾肿瘤相关基因的共表达网络构建与分析

来源：中国生物工程杂志2016年第2期北京时间：

作者：梁栋, 邢永强, 蔡禄

单位：内蒙古科技大学数理与生物工程学院 包头 014010

摘要：作为泌尿系统常见的肿瘤之一,肾肿瘤发病率在逐年上升。针对Affymetrix hgu133b的基因芯片数据进行差异表达基因筛选,应用加权基因共表达网络分析算法构建肾肿瘤差异表达基因的共表达网络。分析肾部正常组织和肿瘤组织差异表达基因之间的关联模式;选取与肿瘤发生关联程度最高的模块,筛选枢纽基因。最后,针对枢纽基因进行基因本体富集分析。细胞衰老是抑制肿瘤发生的主要机制之一,分析结果显示枢纽基因PLA2R1和TBX3与细胞衰老有关,可能对肾肿瘤的形成具有重要影响。该结果与基因PLA2R1通过促进细胞衰老抑制肾部肿瘤发生的研究结论一致。

关键词：肾肿瘤,WGCNA算法,共表达网络,枢纽基因,GO分析

基金资助：国家自然科学基金面上项目(61271448; 11547150)、内蒙古自然科学基金面上项目(2014MS0311; 2014MS0312)资助项目