Primer Spanner:一个高效的定点突变PCR引物设计在线工具

来源：中国生物工程杂志2015年第10期北京时间：

作者：裴智勇, 侯仙慧, 桂小柯, 陈禹保

单位：1. 北京市科学技术研究院北京市计算中心 北京 100094;2. 中国科学院北京基因组研究所 北京 100101;3. 北京大学北京核磁共振中心 北京 100871;4. 北京大学化学与分子工程学院 北京 100094

摘要：基于PCR的实验策略在生物工程研究中具有广泛应用,如定点突变(site-directed mutagenesis, SDM),DNA拼接和载体构建。引物设计是这类实验技术中的关键一环,因其直接影响扩增效率和PCR产物的拼合。在嵌合式引物设计方法(一对突变引物在5'端具有互补序列)的基础上,开发了一个在线工具Primer Spanner (PS),可简单高效获得设计定点突变引物。PS可应用于单碱基或连续多碱基替换、插入、敲除等突变形式。通过大量突变实验与测序验证,结果表明该工具设计的引物进行的定点突变效果良好)。

关键词：PCR,定点突变,引物设计,在线工具