基于宏基因组学技术的开菲尔粒中细菌组成分析

来源：中国食品学报杂志2016年第6期北京时间：

作者：高洁; 崔璐; 袁昕蕾; 何国庆; 霍军生

单位：高洁; 崔璐; 袁昕蕾; 何国庆; 霍军生中国疾病预防控制中心营养与食品安全所;浙江大学生物系统工程与食品科学学院;,

摘要：开菲尔粒是一种天然存在的混菌发酵体系,为乳白色、胶质状颗粒,对牛奶、羊奶等有发酵作用,其发酵产品开菲尔是世界许多国家或地区的传统食品。本文采用宏基因组学技术提取开菲尔粒中总DNA,通过高通量测序和生物信息学分析方法得到8个菌属及其组成比例。试验结果表明,乳酸菌和醋酸菌是开菲尔粒中的优势菌相,占细菌总数的90%;而其余5个菌属,包括链球菌属、希瓦氏菌属、明串珠菌属、假单胞菌属和不动杆菌属,占细菌总数的10%左右。

关键词：开菲尔粒;宏基因组;高通量测序;菌相组成