南美白对虾体表与肠道细菌菌群结构的DGGE分析

来源：中国食品学报杂志2016年第8期北京时间：

作者：张云鹏; 朱立颖; 肖朝耿; 唐宏刚; 陈黎洪; 王欣; 顾青

单位：张云鹏; 朱立颖; 肖朝耿; 唐宏刚; 陈黎洪; 王欣; 顾青浙江工商大学食品与生物工程学院;浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所;浙江省食品微生物技术研究重点实验室;浙江省植物有害生物防控重点实验室;浙江省农业科学院食品科学研究所;,

摘要：采用DGGE技术对南美白对虾体表与肠道的4个部位进行细菌菌群结构分析,结果表明:粪肠球菌和假单胞菌属是南美白对虾肠道细菌的主要成员;葡萄球菌属是体表的优势菌,尤其在腹部占据了绝对优势,包含3个菌种:表皮葡萄球菌、科氏葡萄球菌和巴氏葡萄球菌。不同部位的体表细菌存在差异,头胸部的葡萄球菌比腹部少,只有科氏葡萄球菌,而粪肠球菌与希瓦氏菌比腹部的多。头胸部有鳃,而腹部存在甲壳节与节的连接膜,这些生理结构的差异导致体表细菌菌群结构不同。DGGE图谱还揭示出一些常见的腐败菌分布是不同的,拟态弧菌和豚鼠气单胞菌只存在与肠道中,而希瓦氏菌属仅在体表被检测到。假单胞菌属的不同菌种在南美白对虾的体表与肠道有不同分布,DGGE甚至能检测到出现在体表与肠道的粪肠球菌的菌株不同。这些结果表明DGGE在菌株鉴定方面具有很高的灵敏性,有可能应用在腐败菌溯源方面。

关键词：南美白对虾;肠道菌群结构;体表菌群结构;DGGE

基金资助：杭州市重大科技创新项目(20112312A48); 浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地资助项目(2010DS700124-ZZ1604)