变形假单胞菌PtxS蛋白基因的克隆与分析

来源：中国食品学报杂志2018年第4期北京时间：

作者：张晓飞; 王大明; 孙文敬; 崔凤杰; 李运哲; 齐向辉

单位：张晓飞; 王大明; 孙文敬; 崔凤杰; 李运哲; 齐向辉江苏大学食品与生物工程学院;百勤异VC钠有限公司;江南大学生物工程学院;,

摘要：为从变形假单胞菌中克隆2-酮基葡萄糖酸代谢调控蛋白Ptx S的基因,并明确其基本的生物学信息,采用同源比对的方法设计引物,利用TD-PCR技术克隆Ptx S的基因,再用生物信息学方法对其进行分析。试验结果表明:克隆的基因片段全长1 023 bp,其序列与铜绿假单胞菌、恶臭假单胞菌等假单胞菌的转录调控蛋白Ptx S的基因序列一致性达80%左右,编码由340个氨基酸残基组成的蛋白Ptx S。该蛋白与恶臭假单胞菌Ptx S的同源性最高,氨基酸序列一致性达88%。该蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区,为亲水性蛋白。该蛋白的氨基酸序列中含有多个结构域,其二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规卷曲所占的比例分别为54.41%,13.53%,10.88%和21.18%。本研究为该基因的表达及表达产物的分离纯化提供了理论基础。

关键词：变形假单胞菌;2-酮基葡萄糖酸;PtxS;克隆;生物信息

基金资助：国家自然科学基金项目(31571885); 国家高技术研究发展计划项目(2012AA022103); 江西省科技计划项目(赣知发[2015]64号); 德兴市科技计划项目(德科发[2015]44号)