芒果源植物乳杆菌FMNP01的全基因组测序及序列分析

来源：中国食品学报杂志2018年第5期北京时间：

作者：李雪飞; 郭丽琼; 叶志伟; 刘英丽; 林俊芳

单位：李雪飞; 郭丽琼; 叶志伟; 刘英丽; 林俊芳华南农业大学食品学院;广东省微生态制剂工程技术研究中心;北京工商大学食品质量与安全北京实验室;,

摘要：目的:植物乳杆菌FMNP01是从新鲜热带芒果中分离获得的一株具有较好抗菌活性的乳酸菌。为深入研究其内在抗菌机理,对其进行全基因组测序并解析基因组序列信息。方法:采用高通量测序技术对植物乳杆菌FMNP01进行全基因组测序,采用生物信息学方法对其进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘其细菌素合成相关基因簇信息。结果:通过基因组组装共得到18个重叠群,整个基因组大小为3 313 644 bp,GC含量44.48%。将序列提交至Gen Bank数据库,登陆号为JPSU00000000。在其基因组中发现一段细菌素合成相关基因簇。结论:本研究结果揭示了植物乳杆菌FMNP01抑菌机理,为其功能基因组学研究提供了理论依据。

关键词：植物乳杆菌;全基因组测序;抗菌活性

基金资助：国家自然科学基金项目(31572178,31772373); 广东省科技计划项目(2015A030313425,2015A030310225,2015A020209121); 广州市科技计划项目(201607010197); 北京市教委一般项目(SQKM201610011004)