浆果基因组DNA提取方法比较及PCR优化

来源：中国食品学报杂志2018年第6期北京时间：

作者：李梅阁; 吴亚君; 杨艳歌; 邓婷婷; 王斌; 陈颖

单位：李梅阁; 吴亚君; 杨艳歌; 邓婷婷; 王斌; 陈颖中国检验检疫科学研究院;南京农业大学食品科技学院;,

摘要：为获取高质量的浆果基因组DNA,以8种浆果果实为样品,采用Macherey-Nagel Nucleo SpinR食品基因组提取试剂盒、Qiagen DNeasyR植物基因组提取试剂盒、TIANGEN植物基因组提取试剂盒、Promega WizardR食品基因组提取试剂盒、Biotecon FoodproofR转基因样品纯化试剂盒及Magen Hi Pure食品基因组提取试剂盒6种试剂盒进行DNA提取效果的比较分析。结果显示,Macherey-Nagel Nucleo SpinR食品基因组提取试剂盒、TIANGEN植物基因组提取试剂盒和Magen Hi Pure食品基因组提取试剂盒所得DNA质量较差,DNA严重降解和污染;Qiagen DNeasyR植物基因组提取试剂盒法、Promega WizardR食品基因组提取试剂盒法和Biotecon FoodproofR转基因样品纯化试剂盒均能得到质量较好的DNA,而Promega WizardR食品基因组提取试剂盒法和Biotecon FoodproofR转基因样品纯化试剂盒的DNA完整性低,扩增效率低于Qiagen DNeasyR植物基因组提取试剂盒提取的DNA。最终,以Qiagen DNeasyR植物基因组提取试剂盒作为浆果分子检测中模板DNA提取的通用性方法。

关键词：浆果果实;DNA提取;试剂盒;PCR酶

基金资助：“十三五”重点研发计划项目(2017YFF0211301)