金枪鱼源莓实假单胞菌MS-10全基因组测序及分析

来源：中国食品学报杂志2024年第8期北京时间：

作者：崔方超，王芸婷，刘佳宜，王当丰，檀茜倩，李秋莹，励建荣，李婷婷

单位：崔方超渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,王芸婷渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,刘佳宜渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,王当丰渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,檀茜倩渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,李秋莹渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,励建荣渤海大学食品科学与工程学院 生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心中国轻工业海水鱼加工重点实验室 辽宁锦州 121013,lijr6491@163.com,tingting780612@163.com,李婷婷大连民族大学生命科学学院 辽宁大连 116600,lijr6491@163.com,tingting780612@163.com

摘要：分析莓实假单胞菌环境适应及腐败相关基因，为后续研究其致腐机制提供理论依据。从腐败的冷藏金枪鱼中分离腐败菌，利用根癌农杆菌KYC55筛选具有群体感应的分离株并用气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)检测其分泌的N-酰基高丝氨酸内酯(AHLs)，利用16S rRNA比对及平均核苷酸一致性(ANI)分析确定菌株类型；通过全基因组测序，确定菌株的基因功能及注释信息；利用嗜铁素检测(CASAD)平板法和紫外法检测不同温度下菌株分泌的嗜铁素量；检测接种MS-10的冷藏金枪鱼中菌落总数及挥发性盐基氮变化，结合腐败代谢物产量因子(YTVB-N/CFU)分析MS-10的致腐能力。结果表明:分离株为莓实假单胞菌(MS-10)，能够分泌群体感应信号分子C8-HSL和C10-HSL，其基因组大小为5.25 Mb，GC占比为58.2%。比对多个数据库发现，MS-10的功能基因主要集中在生物代谢、信号转导以及环境应激等方面，包含群体感应调控基因traI/R及大量致腐相关基因。低温条件更有利于MS-10分泌嗜铁素。接种MS-10的金枪鱼块在冷藏期间菌落总数和TVB-N值相比于空白组明显增加，其YTVB-N/CFU值为2.77×10-7 mg/CFU。结论:莓实假单胞菌MS-10具有群体感应系统，为耐冷致腐菌，从基因水平上证明其具有较强的致腐潜力及环境适应性。研究结果为进一步探究MS-10群体感应调控机制，开展其致腐性研究提供数据支撑。

关键词：金枪鱼; 莓实假单胞菌; 全基因组测序; 群体感应; 嗜铁素

基金资助：国家自然科学基金重点项目(U20A2067)；辽宁省自然科学基金博士科研启动基金计划项目(2022-BS-301)