嗜盐四联球菌CGMCC 3792全基因组测序和胞外多糖基因簇分析

来源：中国食品学报杂志2025年第1期北京时间：

作者：张敏，金垚，黄钧，周荣清，迟原龙，吴重德

单位：张敏四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,金垚四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,黄钧四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,周荣清四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,迟原龙四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,吴重德四川大学轻工科学与工程学院 成都 610065,cdwu@scu.edu.cn

摘要：目的:嗜盐四联球菌为一种乳酸菌，其产生的高分子聚合物胞外多糖具有重要的应用价值。为探究嗜盐四联球菌产胞外多糖的分子机制，对该菌进行全基因组测序，并对其基因组和胞外多糖基因簇进行分析。方法:采用纳米孔三代测序技术对嗜盐四联球菌CGMCC 3792的全基因组进行测序，采用生物信息学方法对其进行基因预测和功能注释，并深入挖掘合成胞外多糖的相关基因，在基因水平上分析嗜盐四联球菌CGMCC 3792合成胞外多糖的分子机制。结果:嗜盐四联球菌CGMCC 3792基因组全长2 573 722 bp，编码2 633个基因。对胞外多糖生物合成途径进行分析，发现其可利用甘露糖、果糖、麦芽糖、葡萄糖和纤维二糖合成胞外多糖。通过基因组分析发现，该基因组含有1个15.4 kb的胞外多糖基因簇，其中包括起调控作用的基因epsA和epsB，决定链长的基因epsC和epsD，以及2个糖基转移酶基因和编码翻转酶的基因wzx。结论:本研究在基因水平上揭示了嗜盐四联球菌CGMCC 3792产胞外多糖的分子机制，为其工业化应用奠定了基础。

关键词：嗜盐四联球菌; 纳米孔测序; 胞外多糖; 基因簇

基金资助：国家自然科学基金项目(32272280，31871787)