《中国食品学报杂志》发表论文赏析
作者:张晓莉,杨勇,王光强,艾连中,宋馨
单位:张晓莉上海理工大学健康科学与工程学院 上海 200090,杨勇上海理工大学健康科学与工程学院 上海 200090,王光强上海理工大学健康科学与工程学院 上海 200090,艾连中上海理工大学健康科学与工程学院 上海 200090,宋馨上海理工大学健康科学与工程学院 上海 200090,
摘要:目的:旨在挖掘罗伊氏粘液乳杆菌相关功能基因,以期后续为罗伊氏粘液乳杆菌在食品工业中的开发和应用提供依据。方法:以罗伊氏粘液乳杆菌AR673为对象,通过全基因组测序和比较基因组分析,解析罗伊氏粘液乳杆菌AR673潜在益生功能的分子基础和相关基因。结果:罗伊氏粘液乳杆菌AR673基因组无质粒,染色体长2.04 Mbp,GC含量38.88%,包含2 016个蛋白质编码基因。功能分析发现罗伊氏粘液乳杆菌AR673包含抗菌活性物质合成基因,与环境压力耐受性相关基因以及可移动元件。比较基因组分析发现37株罗伊氏粘液乳杆菌泛基因组呈开放型,数量为5 066个,核心基因为1 190个,另外,还包含1 167个菌株特异性基因。系统发育分析显示罗伊氏粘液乳杆菌AR673和罗伊氏粘液乳杆菌TK-F8A同源性最高,可能具备抑制病原微生物生长,增强宿主免疫系统等益生特性。结论:本研究为丰富罗伊氏粘液乳杆菌的物种进化库,挖掘罗伊氏粘液乳杆菌潜在的益生功能奠定了基础。
关键词:罗伊氏粘液乳杆菌; 全基因组测序; 比较基因组学; 功能基因
基金资助:国家自然科学基金重点项目(U22A20540);上海市教育委员会科研创新计划项目(2101070007800120)