降亚硝酸盐菌株短乳杆菌JYX2的全基因组测序及基因功能分析

来源：中国食品学报杂志2026年第1期北京时间：

作者：李伟，郭辉，董乃慧，任盈，林心萍，纪超凡，张素芳

单位：李伟大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,郭辉大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,董乃慧大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,任盈大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,林心萍大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,纪超凡大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,张素芳大连工业大学食品学院 海洋食品加工与安全控制全国重点实验室 国家海洋食品工程技术研究中心海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心 辽宁大连 116034,zhangsf@dlpu.edu.cn

摘要：从东北自然发酵酸菜中分离获得1株降亚硝酸盐菌株短乳杆菌JYX2，通过溶血试验与抗生素敏感性试验对其安全性进行评估。为阐明短乳杆菌JYX2的基因组特性及其亚硝酸盐降解相关基因，采用Pacbio三代测序与Illumina二代测序技术进行全基因组测序。基于所得序列，通过COG、GO及KEGG数据库进行基因预测与功能注释分析。利用CARD和VFDB数据库分析短乳杆菌JYX2的安全性。结果显示，短乳杆菌JYX2在含100 μg/mL亚硝酸钠的MRS培养基中培养24 h后，其对培养基中亚硝酸钠的降解效率最高可达98.72%。该菌株未表现出溶血性，而对庆大霉素、红霉素、氯霉素等抗生素均高度敏感(抑制圈直径≥20 mm)，显示出良好的安全性。短乳杆菌JYX2的基因组由1条环状闭合的DNA以及1个环状的质粒组成，基因组长度为2 567 154 bp，GC含量为45.82%，可预测2 485个编码基因，65个tRNA基因，15个rRNA基因以及27个sRNA基因。在COG、GO、KEGG、CAZY、CARD和VFDB数据库中，分别注释到1 926，1 762，1 823，73，180，217个功能基因。信息挖掘分析表明，短乳杆菌JYX2的基因组中未检测到亚硝酸还原酶基因，推测其亚硝酸钠降解作用可能依赖于其它酶或机制。此外，毒力基因与耐药性基因的预测分析进一步证实了短乳杆菌JYX2的安全性。综上，短乳杆菌JYX2具有良好的功能和安全性，可用作发酵食品中亚硝酸盐消减的发酵菌剂。

关键词：短乳杆菌; 全基因组测序; 亚硝酸钠; 基因功能注释; 酸菜

基金资助：国家自然科学基金面上项目(32072185)