基于454高通量测序的黄土高原不同乔木林土壤细菌群落特征

来源：中国环境科学杂志2016年第11期北京时间：

作者：刘洋, 曾全超, 黄懿梅

单位：西北农林科技大学资源环境学院, 陕西 杨凌 712100

摘要：选取黄土高原不同乔木林（辽东栎，LDL；侧柏，CB；刺槐，CH；油松，YS）表层土壤为研究对象，利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16S rRNA基因V1~V3可变区测序，通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构，结合土壤的理化性质研究其对细菌群落结构的影响.结果表明：所有土壤样品共检测到36个门，84个纲，187个目.不同乔木林土壤中优势菌来自变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、绿弯菌（Chloroflexi）和浮霉菌门（Planctomycetes），主要的优势菌纲为放线杆菌纲（Actinobacteria）、α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）、酸杆菌（Acidobacteria）、β-变形菌纲（Betaproteobacteria）、浮霉菌纲（Planctomycetacia）.不同乔木林土壤中绿弯菌门（Chloroflexi）与pH值呈极显著的正相关，总磷和蓝细菌（Cyanobacteria）呈极显著的正相关，微生物生物量碳与芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）呈极显著的负相关，土壤总磷含量可能为CB样地区别于其他土样群落组成的主要因素.LDL样地细菌群落受环境影响较小.

关键词：454高通量测序,子午岭,不同乔木林,土壤细菌,环境因子

基金资助：

国家自然科学基金（41171226，41030532）；水利部公益性行业科研专项经费项目（201501045）；新世纪优秀人才支持计划（NCET-12-0479）