《药物分析杂志》发表论文赏析

ITS1作为DNA条形码用于冬虫夏草与其近缘种的鉴别

来源:药物分析杂志2015年第10期北京时间:

作者:张文娟, 魏锋, 马双成

单位:中国食品药品检定研究院, 北京 100050

摘要:目的: 考察内转录间隔区1(ITS1)是否可以作为有效鉴别冬虫夏草的DNA条形码。方法: 提取冬虫夏草及常见伪品虫草的基因组DNA,以聚合酶链式反应(PCR)扩增并测序得到ITS序列,用CondonCode Aligner软件处理得到ITS1序列;从GenBank数据库下载冬虫夏草及常见伪品虫草的ITS1序列。用MEGA软件进行变异位点、Kimura-2-parameter(K-2P)遗传距离、Neighbor-Joining(N-J)进化树分析。结果: 冬虫夏草种内ITS1区存在5个多态性位点;最大种内距离0.039,小于最小种间距离(0.154);在系统进化树中,冬虫夏草聚为一支,可与虫草属其他种类虫草明确区分,Bootstrap值为100%。结论: ITS1可作为理想的DNA条形码用于冬虫夏草与常见虫草属伪品的鉴别。

关键词:冬虫夏草;内转录间隔区;DNA条形码;鉴别,

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