栀子及其近缘茜草科植物、混伪品的rDNA-ITS2序列分析

来源：药物分析杂志2015年第10期北京时间：

作者：黄易1, 唐灿1, 傅俊江2, 成竞梁2, 张春1, 刘芳1, 何峰1,579

单位：1. 四川医科大学药学院, 泸州 646000;2. 四川医科大学医学基础研究中心, 泸州 646000

摘要：目的: 利用rDNA-内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品进行快速鉴定。方法: 对研究材料ITS2片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,序列变异位点采用 PAUP 4.0b10进行统计分析,利用MEGA 5.0软件进行数据分析,并构建邻接(NJ)树,再利用已建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果: 对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品ITS2序列长度为201~235 bp,系统发育树上显示不同来源的样本根据亲缘关系的远近各聚一支,表现出单系性;而同时又与混伪品明显分开。比较ITS2二级结构发现,栀子及其近缘茜草科植物、混伪品在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异。结论: rDNA-ITS2可以方便快捷地鉴定栀子及其近缘茜草科植物、混伪品。

关键词：栀子;茜草科;rDNA-ITS2;DNA内转录间隔区;药材DNA鉴定;二级结构;植物分子鉴定;基因检测,