基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析

来源：药物分析杂志2019年第11期北京时间：

作者：冯震, 杨燕, 张宁, 蒋波, 李芳, 秦峰, 杨美成

单位：上海市食品药品检验所, 国家药品监督管理局药品微生物检测技术重点实验室, 上海 201203

摘要：目的：建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B（gyrB）基因序列鉴定方法，为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法：选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株，以gyrB基因为研究靶点，设计引物，特异性扩增gyrB基因片段，测定核酸序列，并进行聚类比对分析。结果：伯克霍尔德菌属内的典型菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定。结论：本文建立了基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定方法，菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定，为该菌属污染物的鉴定与风险排查提供方法依据。

关键词：伯克霍尔德菌;菌种鉴定;DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因;DNA特征序列;系统发育分析,