基于全基因组平均核苷酸一致性（ANI）的微生态活菌制品菌株分类及命名变化研究

来源：药物分析杂志2025年第8期北京时间：

作者：冯丹阳, 胡文红, 郭君贞, 邢晟, 丁勃

单位：1.山东省食品药品检验研究院 国家药品监督管理局仿制药研究与评价重点实验室山东省食品药品安全检测工程技术研究中心 产业技术基础公共服务平台,济南 250101; 2.中国药科大学生物药物学院,南京 211112; 3.山东大学药学院,济南 250012

摘要：目的: 利用微生态活菌制品中菌株的全基因组序列数据,使用平均核苷酸一致性（ANI）分析,确认微生态活菌制品中菌株的种属信息,进一步明确菌株的分类和命名。方法: 对上市微生态活菌制品中的菌株进行分离和纯化,获取的16个菌株进行高通量测序,采用FastANI软件将菌株全基因组序列与NCBI数据库中经认证的标准菌株基因组进行比对,根据ANI分析结果明确菌株的种属信息。结果: 研究结果表明,16个菌株分别属于11个种,其中有6个种与原命名不一致,涉及超过半数已上市的微生态活菌制品。结论: 建议按照实际种属信息更正部分错误命名的菌株名称,并建立微生态活菌制品生产用菌株遗传信息数据库,定期对菌株进行遗传信息的确认和比对,以保障微生态活菌制品的安全和质量。

关键词：微生态活菌制品,全基因组测序,平均核苷酸一致性（ANI）,菌株分类,遗传信息数据库,