表达谱芯片筛选獭兔毛色相关候选差异表达基因

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第4期北京时间：

作者：施丽娟，秦立志，王文洲，闫晓荣，翁巧琴，吴信生

单位：1.扬州大学动物科学与技术学院，扬州 225009；2.江苏省动物繁育与分子设计重点实验室，扬州 225009；3.浙江省余姚市欣农兔业有限公司，余姚 315400

摘要：本研究旨在了解青紫蓝色獭兔和白色獭兔毛色形成的分子遗传学机理。试验分为3组，每组包含全同胞青紫蓝獭兔和白色獭兔各1只。利用安捷伦基因芯片技术分析不同分组之间差异基因表达情况，并通过实时荧光定量PCR方法对部分差异显著基因进行验证。差异表达分析结果显示，3组青紫蓝色獭兔对白色獭兔分别筛选出545、1 680和2 092个差异表达基因 (Differentially expressed genes，DEGs)，共有172个共同基因；GO(Gene Ontology)分类结果显示，这些基因主要参与细胞分化、增殖、凋亡、发育、离子转运、免疫应答等生物学过程。通过实时荧光定量PCR技术对Creb1、Wnt2、Gnaq和Gna14基因在组织样中的表达量进行检测，结果与表达谱芯片一致。通过表达谱芯片结果结合生物信息学分析和文献报道，筛选出了Creb1、TH、Wnt2、Gnaq、Dvl1、Mapk12等对毛色形成可能具有重要影响的候选基因。

关键词：

基金资助：现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-44-1）；江苏省高校优势学科建设工程资助项目（PAPD-2014-134）