传染性支气管炎病毒S1和N基因遗传变异频率的分析

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第6期北京时间：

作者：盛晓丹，徐怀英，刘霞，黄迪海，曲新泽，秦卓明

单位：1.山东省农业科学院家禽研究所，济南 250100；2.山东省健牧生物药业有限公司，济南 250100

摘要：旨在探讨中国北方地区传染性支气管炎病毒（IBV）的流行和分子变异，进而探讨IBV的遗传演变规律。利用生物信息学方法对IBV纤突蛋白（S1）和核蛋白（N）编码基因进行分析比较。结果显示：2012—2013年发生在山东、天津等北方地区的IBV流行株高度同源，其S1基因核苷酸（氨基酸）相似性为94.0%~100%（93.1%~100%），N基因为98.4%~99.1%（98.1%~99.8%），而与经典疫苗株H120相似性均较低，且至少在S1基因的3个高变区产生了较多的点突变、缺失和插入，且变异集中在第53—150和250—290位，以高变区HVR I居多，GM/13在 62—65位缺失4个氨基酸。进一步的分析表明：IBV流行株S1基因与1998年在我国北方流行的A2株核苷酸相似性最高，为94.9%~97.2%，年核苷酸（nt）变异频率平均为2.4 nt×10-3；而N基因则与LX4株相似性最高，为93.0%~93.5%，年变异频率平均为5.1 nt×10-3。IBV流行株可能是A2-like和LX4-like毒株的重组，且N基因的变异频率明显高于S1基因。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31372332）；科技部农转资金（SQ2013ECC600059）；山东省科技攻关重点支持项目（2009GG10009006）；济南市成果转化支持项目(2012CG92)