关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第7期北京时间：

作者：张雯，许厚强，陈伟，陈祥，桓聪聪，夏丹，周迪

单位：1.贵州大学 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵阳 550025；2.贵州大学动物科学学院，贵阳 550025；3.贵州大学生命科学学院，贵阳 550025

摘要：本研究旨在筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。根据GenBank已公布的牛MyoDI基因的启动子序列，设计特异性PCR引物，扩增贵州关岭牛MyoDI基因的启动子区，构建重组克隆载体pUCM-T-MyoDI -pro，并对阳性质粒进行测序鉴定。再利用筛选试验和生物信息学分析筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点。结果，筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有的转录因子结合位点有SATB1、Xbp、MEF2、Pax-3、Pbx1、PPAR、TFⅡD、COUP-TF、Gfi-1、HNF-1、HOX4C、NRF2(ARE)、MEF1、RXR、SMUC、Snail、MyoD、VDR。结合在线软件分析和文献，最终筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点，这些转录因子对启动子活性起着重要的调控作用。结果显示，关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点。

关键词：

基金资助：国家转基因生物新品种培育重大专项（2013ZX08009-004）；黔科合重大专项贵州畜禽种质资源保存、创新与利用（字［2013］6008号）；贵州省科技厅农业攻关项目（黔科合NY字［2012］3008号）；贵州大学研究生创新基金（研农2014021）