牦牛AQP9基因CDS全长序列克隆及其生物信息学特征分析

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第7期北京时间：

作者：刘健锋，丁艳平，伍志伟，王建林，邵宝平

单位：1．兰州大学生命科学学院，动物学与发育生物学研究所，兰州 730000；2.西北师范大学生命科学学院，兰州 730070；3.甘肃中医学院 系统生物学与中医药转化研究所，兰州 730020

摘要：为了研究高原动物对青藏高原极端生境的适应机理，并为探讨高原动物适应机制提供基本数据。本研究运用基因克隆技术对牦牛脑AQP9基因CDS全长序列进行克隆，采用生物信息学方法进行分析，AQP9基因和编码序列特征进行了以下几方面的预测和分析：其物化性质、疏水性、跨膜结构和蛋白二级结构。结果表明，牦牛AQP9的CDS含有一个885 bp的开放阅读框，编码295个氨基酸；牦牛AQP9基因编码蛋白分子量和理论等电点分别为31.89 ku和6.21，其编码蛋白含有6次跨膜结构，属于疏水性蛋白；二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠及无规则卷曲构成；牦牛AQP9基因编码氨基酸序列与黄牛、藏羚羊、绵羊等物种间同源性较高，系统进化情况与其亲缘关系远近一致。本研究将为牦牛低氧适应性研究提供一定的基础资料。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金项目（青年基金：31000190；地区基金：31060141）；兰州大学中央高校基本科研业务费专项