狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第9期北京时间：

作者：李英杰，刘铮铸，巩元芳，徐桂利，张磊，唐家明， 段玲欣，刘谢荣，郭秀玲，陆奇玉

单位：1.河北科技师范学院动物科技学院，秦皇岛 066004；2.河北昌黎县畜牧发展局，昌黎 066600

摘要：旨在探究狐狸刺豚鼠基因（Agouti）多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系。本研究采用PCR和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的Agouti基因部分序列进行了SNPs筛查和单倍型分析。结果表明，在已测序的58只狐狸中首次发现6个SNPs（g.269G>T、g.295C>T、g.325T>G、g.518G>A、g.608C>A和g.846G>A），它们全部存在于内含子2上。狐属的所有个体（25只）在6个位点全部为纯合子基因型，依次为GG、CC、TT、GG、CC和GG型，而北极狐属的所有个体（33只）在这6个位点则均为另一种纯合子基因型，依次为TT、TT、GG、AA、AA和AA型。6个SNPs形成两种单倍型：单倍型Ⅰ（H1：GCTGCG）和单倍型Ⅱ（H2：TTGAAA），分布频率分别为42.1%和57.9%。单倍型Ⅰ（H1）分布于狐属3个狐种的所有受试个体中，单倍型Ⅱ（H2）分布于北极狐属两个狐种的所有受试个体中。进一步分析没有发现6个SNPs及其单倍型与狐狸毛色的明显关联性，但推测它们是区分狐属和北极狐属的重要功能位点和重要单倍型。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31040048；31272412）；河北省高等学校创新团队领军人才培育计划（LJRC004）；河北省自然科学基金（C2013407101）