牛卵泡ODF1与ODF2转录组发育相关基因筛选及表达差异分析

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第11期北京时间：

作者：李鹏飞，孟金柱，谢建山，朱芷葳，刘岩，姜晓龙，陈建伟，姚晓磊，赵妙妙，吕丽华

单位：(1.山西农业大学生命科学学院，太谷 030801；2.山西农业大学动物科技学院，太谷 030801)

摘要：旨在从牛发情周期第一卵泡波中最大卵泡ODF1（The largest follicle at onset of deviation）和第二大卵泡ODF2（The second largest follicle at onset of deviation）转录组水平上筛选卵泡发育差异表达基因。采集牛发情周期第一卵泡波ODF1和ODF2，分别分离颗粒细胞并提取总RNA，构建RNA文库，通过Illumina平台对ODF1和ODF2测序；筛选出ODF1与ODF2两个转录本之间比值大于2的差异表达基因，并采用qRT-PCR对筛选出的基因在牛发情周期内第一卵泡波优势卵泡（Dominant follicles，DF）和从属卵泡（Subordinate follicles，SF）颗粒细胞中功能验证。共获得8个卵泡发育差异表达基因，其中7个基因筛选自ODF1/ODF2（BEX2、UBN1、SIK1、SPARCL1、LOC784256、LOC789231和LOC785462），1个筛选自ODF2/ODF1（SAFB2）；qRT-PCR结果表明，BEX2、UBN1、LOC784256和LOC789231在DF中mRNA表达量极显著高于SF（P<0.01），SAFB2在SF中mRNA表达量极显著高于DF（P<0.01），SIK1和SPARCL1在SF中mRNA表达量显著高于DF（P<0.05），虽然LOC785462在SF中mRNA表达量高于DF，但差异不显著（P>0.05）。qRT-PCR检测BEX2、UBN1、LOC784256、LOC789231和SAFB2的结果与高通量测序中该基因在ODF1和ODF2的RPKM的差异趋势基本一致，而SIK1、SPARCL1和LOC785462不一致。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31172211）；农业部948项目（2010-Z43）；山西省横向协作与委托项目（2010HX54）；山西省回国留学人员科研资助项目（2014-重点5）；山西省科技攻关项目（20130311027-2）；山西省人事厅人才引进项目；山西农业大学引进人才博士科研启动费(2014ZZ04)；科研管理费资助重大项目；标志性成果培育项目（71060003）