基于线粒体12S基因分析四川地区鸡异刺线虫的种群遗传多态性

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第12期北京时间：

作者：王保健，朱俊扬，简克灵，杨光友，汪涛，赖为民，赵习彬，廖晓霞，古小彬

单位：四川农业大学动物医学院，成都 611133

摘要：为探讨四川地区鸡异刺线虫的遗传变异特点和种群遗传结构特征，利用PCR技术扩增了四川7个地区共58株鸡源鸡异刺线虫分离株的线粒体12S基因全序列，经测序后分析其遗传多样性。结果显示，58条鸡异刺线虫12S基因全序列均为699 bp，序列中共有38个变异位点和34个单倍型（HS1-HS34）；单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（π）分别为0.822和0.003 95。进一步分析表明，7个地理种群遗传分化不明显（Fst=0.007 87），种群间基因交流较频繁（Nm=31.52）；分子方差分析（AMOVA）表明，四川地区鸡异刺线虫的遗传分化主要来自于种群内部（99.21%），种群间遗传变异水平较低（0.79%）；单倍型网络图和NJ系统发育树显示，鸡异刺线虫7个地理种群的34个单倍型散在分布于不同种群内，分布格局较为混杂，未形成明显的地理分布格局。结果表明，四川地区的鸡异刺线虫遗传多样性较低，遗传分化不明显，还未形成显著的地理遗传结构。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金青年基金项目（31402188）；四川农业大学学科“双支计划”（03570422）