德保矮马X染色体选择信号筛选

来源：畜牧兽医学报杂志2015年第12期北京时间：

作者：刘雪雪，阿地力江?卡德尔，董坤哲，王月月，潘建飞，浦亚斌，何晓红，马月辉，蒋琳

单位：1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，北京 100193； 2.甘肃农业大学动物科学技术学院，兰州 730070

摘要：旨在对德保矮马（Debao pony）X染色体的选择信号进行筛选。本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip，对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描，获得2 339个SNPs位点。通过群体分化系数FST法和XP-EHH两种不同的方法，分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测。结果，筛选到两个受到较强选择区域4.0～39.9和87.1～123.5 Mb，包含64个“离群位点”。通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因。研究结果发现，德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择，其中部分在马中未见报道，可以作为研究矮小性状的重要候选基因。

关键词：

基金资助：农业科技创新项目（ASTIP-IAS01）；国家自然科学基金项目（31272403）