《畜牧兽医学报杂志》发表论文赏析

梅花鹿致敏与休眠鹿茸干细胞差异蛋白表达的2D-DIGE分析

来源:畜牧兽医学报杂志2016年第1期北京时间:

作者:董振,王权威,刘振,孙红梅,李春义

单位:中国农业科学院特产研究所,特种动物分子生物学国家重点实验室,长春 130112

摘要:旨在对梅花鹿(Cervus nippon)致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞表达蛋白进行差异筛选、鉴定及生物信息分析,为深入探讨鹿茸独特的再生分子调节机制奠定基础。本研究采用双向荧光差异凝胶电泳(Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE)分离蛋白样品;利用DeCyder 7.2 分析软件对2D-DIGE图像进行统计学分析寻找差异表达蛋白;利用MALDI-TOF-MS (Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry)鉴定差异蛋白,通过Mascot 软件搜索NCBInr 数据库寻找匹配的蛋白;采用PANTHER (Protein Analysis Through Evolutionary Relationships) 软件对差异蛋白进行聚类分析,REACTOME数据库分析差异蛋白所参与的信号通路。结果得到了致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞2D-DIGE图谱,致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白丰度相比较,比值≥1.1倍以及比值≤-1.1倍(P<0.05)的差异蛋白点有159个,其中110个上调表达,49个下调表达,EDA(Extended data analysis)分析得到了多个Marker蛋白,质谱鉴定了84 个差异蛋白质点,48个为阳性结果,共来自27 种蛋白质。并对已鉴定蛋白进行了GO分析以及信号通路富集分析。致敏鹿茸干细胞与休眠鹿茸干细胞蛋白差异明显,质谱鉴定获得了来自多种可能与鹿茸再生相关的差异蛋白。由此可知,鹿茸再生是鹿茸干细胞从休眠到致敏的转化过程,需要多种蛋白分子以及信号通路的综合调控。

关键词:

基金资助:国家高技术研究发展计划(863)项目(2011AA100603);国家自然科学基金项目(31170950);吉林省重点科技攻关项目(20150204071NY);吉林省自然科学基金项目(20140101139JC)

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