基于线粒体细胞色素氧化酶b(cytb)全基因序列分析我国部分地区兔痒螨的遗传变异特征

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第4期北京时间：

作者：赵习彬, 王保健, 简克灵, 杨光友, 赖为民, 古小彬

单位：四川农业大学动物医学院, 成都 611133

摘要：为探讨兔痒螨是否会受兔品种、温度带和地域来源的不同而出现遗传变异，采用PCR技术首次对我国6个省份共68个獭兔来源（陕西、河北、河南和湖北）和肉兔来源（山东和四川）痒螨虫株的线粒体细胞色素氧化酶b（cytb）基因全序列进行扩增，经测序后分析遗传变异情况。68条兔痒螨cytb全序列均为1 100 bp，共有96个（8.7%）变异位点和46个单倍型；我国整体种群的单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（π）分别为0.959 2和0.012 0，具有较高的遗传多样性；我国兔痒螨整体种群的中性检验结果为负值（Tajima's D=-0.444 01，Fu's Fs=-1.454 25），且呈现多峰的错配分布曲线现象，暗示我国兔痒螨可能经历过突增长过程；我国所有种群间存在一定的遗传分化（Fst=0.262 2）、基因流水平较低（Nm=0.7）；分子方差（AMOVA）分析表明遗传分化主要发生在种群内；单倍型网络图和NJ树显示我国兔痒螨的聚类与兔品种、温度带和地理来源无关。结果表明，我国6个地区的兔痒螨虫株呈现较高的遗传多样性，具有一定的遗传分化，但未形成以兔品种、温度带和地理分布为格局的遗传结构。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金青年基金项目（31402188）；四川农业大学学科“双支计划”（03570422）