《畜牧兽医学报杂志》发表论文赏析

营养诱导舍饲哈萨克羊非繁殖季节卵巢组织中miRNAs差异表达分析

来源:畜牧兽医学报杂志2017年第4期北京时间:

作者:雷小萍, 林杉, 于要升, 梁慧慧, 赵宗胜

单位:1. 石河子大学动物科技学院, 石河子 832003;2. 石河子大学生命科学学院, 石河子 832003

摘要:旨在利用Solexa测序技术分析、挖掘营养诱导非繁殖季节绵羊发情期和乏情期卵巢组织micro RNAs(miRNA),为进一步研究特定miRNA参与非繁殖季节绵羊发情的分子调控机制提供理论基础。以不同营养水平饲喂的哈萨克绵羊作为研究对象,在非繁殖季节前后分别屠宰已鉴定的3只发情(EN)和乏情(AN)母羊,分别采集卵巢(O)组织,构建两个小片段RNA文库(OEN和OAN),进行高通量测序和生物信息学分析,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达的miRNAs在哈萨克羊卵巢中表达水平。结果显示,两文库分别获得8 665 978(发情期)和9 071 102条(乏情期)clean reads,且绝大多数小RNA序列长度为21~23 nt。两文库相比较,发现有9个已知和104个未知miRNAs表达差异显著(P<0.01)。利用qRT-PCR随机选择的6个显著差异表达的miRNAs进行验证,其表达水平和测序分析结果一致。KEGG通路分析表明,这些差异miRNAs的靶基因主要参与了甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,氨基糖和核苷酸糖代谢,精氨酸和鸟氨酸代谢及甘油磷脂代谢等营养调控通路。结合靶基因预测及通路富集分析,推测差异表达的miRNAs是通过营养代谢通路对绵羊的非季节性发情起重要作用。

关键词:

基金资助:国家自然科学基金项目(31260537)

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