奶牛分子系谱构建或亲权鉴定的微卫星标记筛选

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第4期北京时间：

作者：殷彬, 岳书俭, 俞英, 曹巧巧, 王中华, 师科荣

单位：1. 山东农业大学动物科技学院, 山东省动物生物工程与疾病防治重点实验室, 泰安 271018;2. 中国农业大学动物科技学院, 农业部畜禽遗传育种重点实验室, 畜禽育种国家工程实验室, 北京 100193

摘要：旨在利用较少的经过优化的遗传标记组合达到快速高效的亲缘鉴定，最终可有效应用于奶牛群体亲子鉴定与系谱构建。本研究从国际动物遗传学会（ISAG）数据库中初步选择了18个多态性较高的微卫星位点，经PCR优化验证获得可高效扩增的8个位点，并检测其在300头中国荷斯坦牛群体中的多态性分布。这些微卫星位点的亲子鉴定效力检测结果表明，8个标记平均等位基因数为14.63，平均多态性信息含量（PIC）为0.747，群体平均观察杂合度（Ho）为0.718，平均期望杂合度（He）为0.773。3种不同情形下进行亲子鉴定时8个位点的结合排除概率（CPE）均≥0.990。8对父子牛亲权鉴定结果表明，利用该8个标记可以识别并剔除系谱中的错误记录。结合排除概率的分析结果表明，当微卫星位点数增加至4个（TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103）时，3种不同情形下的CPE均≥0.949，可以满足个别案例牛亲子鉴定的要求。群体分子系谱构建的结果表明，当微卫星位点数大于或等于6个时，群体内近交系数和总群体近交系数均明显升高。因此，在生产实践中推荐使用TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103、INRA037、INRA134位点进行小规模群体（<200）的分子系谱构建或亲权鉴定。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31402054）；山东省自然科学基金（ZR2013CM013）；山东省农业良种工程项目（2016LZGC030）；国家现代奶业产业技术体系（CARS-37）；山东省泰山学者种业创新人才团队计划培养项目（2014LZ07-04）