山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的miRNA表达谱变化分析

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第5期北京时间：

作者：李基棕, 李文良, 毛立, 郝飞, 杨蕾蕾, 张纹纹, 江杰元

单位：江苏省农业科学院兽医研究所, 农业部兽用生物制品工程技术重点实验室, 南京 210014

摘要：本研究旨在分析山羊副流感病毒3型（CPIV3）感染MDBK细胞和正常MDBK细胞差异表达的miRNA，以探索miRNA在CPIV3感染过程中的作用及其调控机制。将CPIV3感染MDBK细胞，利用高通量测序技术检测分析MDBK细胞中miRNA表达谱，并筛选差异表达的miRNA。对靶基因进行GO注释和KEGG富集。结果显示，有37个miRNA显著差异表达（P＜0.001），其中18个miRNA在病毒感染中上调，19个miRNA在病毒感染中下调。经RT-qPCR方法验证5个差异表达的候选miRNA，结果与高通量测序分析有很好的一致性。进一步GO功能注释表明：差异表达的miRNA靶基因生物学功能相对集中在免疫调节、细胞生物调控及细胞新陈代谢等生物过程。这些靶基因参与多种细胞的信号通路，包括细胞黏附分子、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、代谢通路、黏合斑、钙离子信号通路和趋化因子信号通路等。本研究为进一步探讨CPIV3致病机制奠定了基础。

关键词：

基金资助：江苏省农业科技自主创新资金项目[CX（15）1061]；国家自然科学基金（31402180）；十三五国家重点研发计划项目（2016YFD0500908）