基于通路分析方法诠释肉鸡体重性状全基因组关联研究

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第5期北京时间：

作者：王杰, 刘璐, 刘杰, 赵桂苹, 刘冉冉, 郑麦青, 文杰

单位：1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193;2. 动物营养学国家重点实验室, 北京 100193

摘要：本研究旨在通过对体重和日增重进行基于通路的关联分析，以期获得影响体重和日增重的信号通路。对北京油鸡与科宝肉鸡F2资源群体14、28、56、93日龄体重及0~14、14~28、28~56、56~93日龄日增重分别进行全基因组关联分析，利用关联分析获得的显著性SNP位点进行基于通路的关联分析（SNP ratio test）。结果表明，14日龄体重与类固醇激素的生物合成相关联（P<0.05），56日龄体重与烟酸/烟酰胺的代谢相关联（P<0.05），93日龄体重与糖酵解/糖异生相关（P<0.05），且各日龄体重性状均与氨基酸的代谢过程相关联（P<0.05）。在增重最快的42~56日龄，与日增重相关的SNP富集到的通路最多，这些通路主要集中在TCA循环、类固醇合成、类固醇激素的生物合成、氧化磷酸化、磷酸肌醇代谢、甘油磷脂代谢等过程。在肉鸡体重迅速增长阶段类固醇激素的生物合成起到了重要作用，且氨基酸代谢过程与日增重显著相关。

关键词：

基金资助：国家现代农业肉鸡产业技术体系（CARS-42）；中国农业科学院科技创新工程（ASTIP-IAS04）