鸡ev21占位区和未占位区重复序列结构与羽速表型关系研究

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第6期北京时间：

作者：张乐超, 王晗, 张秀玲, 刘春杨, 王麒, 周荣艳, 李祥龙, 李兰会

单位：1. 河北农业大学动物科技学院, 保定 071001;2. 河北科技师范学院, 秦皇岛 066600;3. 西北农林科技大学动物科技学院, 杨凌 712100;4. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

摘要：本试验旨在探讨鸡羽速基因型Hae Ⅲ酶切鉴定方法的分子基础。以羽型明确的6个品系（太行鸡、坝上长尾鸡、大午粉鸡、海兰灰鸡、海兰褐鸡、海兰灰祖代四系鸡）313份鸡基因组为模板，利用Hae Ⅲ酶切的RFLP试验进行羽速验证，并对ev21占位区（OS）和非占位区（US）共有序列以及OS区特有序列进行酶切试验。结果表明：1）Blast分析发现1 450 bp为鸡ev21的US区域片段。海兰灰及其祖代四系和大午粉祖代的羽速基因型与Hae Ⅲ酶切结果完全一致，但太行慢羽公鸡、慢羽母鸡、坝上长尾慢羽公鸡和海兰褐慢羽鸡的一致率分别为40.0%、27.6%、28.6%和0.0%；2）太行鸡和坝上长尾鸡ev21的OS和US区共有序列538 bp酶切鉴定结果与表型一致率达到92%以上，其他品系（除海兰褐快羽公鸡为0.0%）均为100.0%；3）鸡ev21的OS区特异序列1 440 bp的扩增阳性率在太行慢羽公鸡、慢羽母鸡和快羽公鸡中的阳性率分别为94.1%、65.5%和0.0%，在海兰灰祖代鸡中分别为100.0%和0.0%，并且1 440片段不能被Hae Ⅲ切开。综合分析6个品系ev21的OS和US区结构特征，认为US区Hae Ⅲ酶切位点变异不能作为慢羽和内源病毒ev21的鉴定依据，而OS区的ev21插入与1 440 bp序列Hae Ⅲ酶切位点的A→G突变和八碱基重复是紧密连锁的。

关键词：

基金资助：河北省现代农业技术体系蛋鸡产业创新团队（HBCT2013090206）；河北省自然科学基金（C2015204176）