16S rRNA高通量测序方法检测羊圈空气微生物群落结构及多样性

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第7期北京时间：

作者：孙翠丽, 张阁, 程汝佳, 朱良全, 丁家波, 常维山

单位：1. 山东农业大学动物科技学院, 泰安 271018;2. 中国兽医药品监察所, 北京 100083

摘要：以羊圈空气微生物为研究对象，了解羊圈空气中细菌群落结构以及致病菌属特征。将来自10个不同羊场的羊圈空气样本，应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定羊圈空气中细菌的16S rRNAV3-V4变异区序列，分析不同空气样本细菌群落组成。结果显示：空气样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为33 408，涵盖了25门、66纲、123目、253科、547属、444种的细菌。通过微生物多样性进行分析以及羊圈空气样本菌群中丰度较高的病原菌属的统计，以期为羊场的消毒和用药提供依据。本研究解析了羊圈空气样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征，对羊场疾病防控有一定指导意义。

关键词：

基金资助：国家重点研发计划（2016YFD0500902）