牛体外受精胚胎抗氧化相关的长链非编码RNA表达谱

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第7期北京时间：

作者：郭芹芹, 李凤, 孙尉峻, 郝海生, 刘岩, 赵学明, 庞云渭, 朱化彬, 杜卫华

单位：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193

摘要：旨在探究培养液中添加3 mmol·L-1谷胱甘肽（Glutathione，GSH）对牛体外受精胚胎中长链非编码RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）表达谱的影响。收集8~16-细胞期和桑椹期的胚胎，构建文库后测序，筛选差异lncRNAs，共表达分析后，获得的差异基因进行GO功能注释和KEGG通路分析；同时对lncRNA进行了顺式作用靶基因的预测及其功能分析；通过荧光定量PCR对8个lncRNAs表达水平进行检测，验证测序结果的准确性。测序共得到4 273个lncRNAs，通过对其表达量、长度和外显子个数分析表明，测序数据的可靠性较好。筛选共得到59个差异lncRNAs （其中23个在对照组（不添加GSH）上调，而在处理组（添加3 mmol·L-1GSH）下调；36个在对照组下调，而在处理组上调），在对照组和处理组中，59个lncRNAs分别与754和2 782个蛋白编码基因共表达，这些基因分别参与47和48个功能分类，且主要富集于5和13条信号通路。对23和36个差异lncRNAs临近的145和154个蛋白编码基因进行GO注释，结果表明，这些基因分别参与35和43个功能分类。14个lncRNAs共表达的差异基因参与谷胱甘肽代谢通路。综上表明，在培养液中添加GSH能导致胚胎lncRNA表达谱的变化。

关键词：

基金资助：中国农业科学院科技创新工程"家畜胚胎工程与繁殖创新团队"（ASTIP-IAS06-2017）；国家科技支撑项目（2012BAD12B01-2）