水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第9期北京时间：

作者：蔡小艳, 鲍正攀, 古景开, 邓凯, 张晓溪, 任艳萍, 沈朋雷, 石德顺, 刘庆友

单位：1. 广西大学 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁 530004;2. 广西壮族自治区畜牧研究所, 南宁 530001

摘要：旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制。采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织，利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱，鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs，分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布，发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs。结果显示，本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱，分别获得12 768 110和12 569 467条18~31 nt的高质量序列。测序确认了归属259个miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个pre-miRNAs及5个水牛特有的miRNAs。U是19和25 nt miRNAs的5'端最普遍的核苷酸。bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2个时期均呈现高表达；bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特异性高表达。bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特异性高表达。bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表达量下降为非泌乳期的1/2以下。而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期表达量大于或等于2倍非泌乳期丰度。本研究构建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺组织2个miRNAs表达谱，测序确认了259个水牛miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个前体miRNAs，5个水牛特有miRNAs和10个高差异表达miRNAs，为进一步阐明奶水牛泌乳关键miRNAs作用机制奠定了基础。

关键词：

基金资助：国家863重点项目课题（2013AA102504）：广西科技厅项目（桂科合14125008-2-13；桂科AD17129043；桂科AA16380026）