猪基因共表达网络模块的构建及功能分析

来源：畜牧兽医学报杂志2017年第11期北京时间：

作者：魏凯, 张婷婷, 马磊

单位：石河子大学生命科学学院, 石河子 832000

摘要：旨在构建猪（Sus scrofa）的基因共表达网络模块，挖掘功能基因。基于权重基因共表达网络分析技术（Weighted gene co-expression network analysis，WGCNA），利用猪的多组织转录组测序数据，构建了24个猪的基因共表达模块，并对模块进行生物学过程、KEGG通路、疾病和组织特异性分析。结果显示，模块具有功能特异性，与器官的发育阶段、代谢通路有关，且同一模块中的信号通路间呈现调控关系；模块可富集与代谢、神经系统、癌症相关的疾病基因；模块可定位于特定组织。分析发现，钙调通路、PI3K-Akt通路、MAPK通路、泛素介导通路等在模块中呈现关键作用，催产素通路、昼夜节律通路内的相关基因对繁殖调控具有重要作用，SIX1、PRKAG3等基因的局部网络涉及肌肉发育。综上表明，在基因组水平上，构建和分析基因表达调控网络，可为探究中国地方猪品种特有的基因资源信息、丰富分子育种理论，提供新思路和新途径。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31272416；31560310）