旋毛虫plancitoxin-1-like基因的序列分析与编码蛋白结构预测

来源：畜牧兽医学报杂志2018年第1期北京时间：

作者：廖成水, 王晓利, 田文静, 杨亚东, 张梦珂, 王安琪, 张春杰, 刘明远, Boireau Pascal, 程相朝

单位：1. 河南科技大学, 动物科技学院/洛阳市活载体生物材料与动物疫病防控重点实验室, 洛阳 471023;2. 河南科技大学 医学院, 洛阳 471023;3. 洛阳职业技术学院, 洛阳 471003;4. 吉林大学 人兽共患病研究所/人兽共患病研究教育部重点实验室, 长春 130062;5. 法国国家食品、环境及劳动卫生署动物卫生实验室, 迈松阿尔福 94706

摘要：基因组预测旋毛虫拥有125种庞大的DNase Ⅱ家族蛋白，但只有plancitoxin-1唯一在C端含有一个保守的DNase Ⅱ活性位点（HKD基序）。为研究旋毛虫plancitoxin-1基因的序列结构特征，以旋毛虫总RNA为模板进行RT-PCR，获得plancitoxin-1基因的序列，并利用生物信息学方法进行系统性分析。结果显示，扩增得到的核苷酸序列比GenBank中相关序列短210 bp，编码294个氨基酸，由20种氨基酸组成，重新命名为plancitoxin-1-like，且氨基酸序列中在N端和C端都具有HKD基序。蛋白质理论相对分子质量为33.19 ku，等电点为9.17，是稳定存在的亲水性蛋白。Plancitoxin-1-like的氨基酸序列与其他物种DNase Ⅱ的相似性为35%左右。Plancitoxin-1-like含有4个N-糖基化位点、3个O-糖基化位点、31个磷酸化位点、17个B细胞线性结合位点和9个T细胞结合位点以及3个二硫键。二级结构中，α-螺旋占14.29%（42个），延伸链占28.23%（83个），无规卷曲占55.10%（162个）。本研究成功克隆旋毛虫plancitoxin-1-like基因，对其序列结构进行分析，为进一步研究庞大的DNase Ⅱ家族蛋白在旋毛虫发育和感染中的作用奠定基础。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31030064）；国家自然科学基金面上项目（31572489）；河南科技大学博士启动基金（13480071）；河南省高等学校重点科研项目计划（17A230009）