利用Y染色体基因分析梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源

来源：畜牧兽医学报杂志2018年第2期北京时间：

作者：周永娜, 刘华淼, 鞠妍, 张然然, 王磊, 董世武, 邢秀梅

单位：中国农业科学院特产研究所 特种经济动物分子生物重点实验室, 长春 130112

摘要：旨在利用Y染色体基因研究梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源，为梅花鹿的保种育种工作提供数据支持。对171只双阳、敖东、四平、东丰、兴凯湖、长白山和东大梅花鹿种公鹿Y染色体上的AMELY、DBY、USP9Y、SRY基因的5个片段进行PCR扩增，对PCR产物进行直接测序和生物信息学分析。结果表明，5个基因片段共筛选到8个突变位点，AMELY1、AMELY2、DBY、USP9Y、SRY基因片段分别有3、2、1、1、1个突变位点。利用DNASP5.1软件共定义了10种单倍型，分别为H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10，其中H1是优势单倍型，占梅花鹿种公鹿群体的49.1%，H5和H10为东丰梅花鹿种公鹿独有，H9是最原始的单倍型。171只梅花鹿种公鹿的单倍型多样性为0.696 80，核苷酸多样性为0.000 36。NJ系统进化树和structure群体结构分析结果表明，梅花鹿种公鹿有3个父系类型，分别为Y1、Y2和Y3，除双阳梅花鹿种公鹿和四平梅花鹿种公鹿均来自Y3，其余梅花鹿种公鹿群体均为多父系类型。表明我国梅花鹿种公鹿Y染色体具有较高的单倍型多样性和极低的核苷酸多样性。

关键词：

基金资助：中国农业科学院科技创新工程（CAAS-ASTIP-201X-ISAPS）