斯氏副柔线虫CAMK/TSSK蛋白激酶基因的克隆及其蛋白质结构与抗原表位预测分析

来源：畜牧兽医学报杂志2018年第3期北京时间：

作者：王文龙, 赵学亮, 孙柯, 冯陈晨, 白丽艳, 王姝懿, 王梦雅, 刘春霞

单位：1. 内蒙古农业大学兽医学院, 农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室, 呼和浩特 010018;2. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018;3. 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心, 呼和浩特 010018;4. 内蒙古农业大学生命科学学院, 呼和浩特 010018

摘要：为分析并预测斯氏副柔线虫免疫相关基因CTPK编码蛋白结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性，通过提取斯氏副柔线虫组织RNA，反转录合成cDNA，设计特异性引物以扩增CTPK基因的CDS区，并利用生物信息学软件对CTPK进行蛋白质结构分析和抗原表位预测。生物信息学分析表明，CTPK基因cDNA序列全长共519 bp，具有完整的开放阅读框（519 bp），编码173个氨基酸，相对分子质量和等电点大小分别为20.264 ku和9.53。结构分析发现，蛋白质无跨膜区，无规则卷曲构成二级结构的主要组分，亲水性氨基酸比例超过60%；抗原表位预测表明，CTPK蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白，既含有较多潜在的B细胞抗原表位又存在较多的T细胞抗原表位。推测CTPK有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原，本研究为骆驼斯氏副柔线虫生前诊断方法iELISA的建立和DNA疫苗的研究奠定了理论基础。

关键词：

基金资助：国家自然科学基金（31260603）；内蒙古自然科学基金（2016MS0341）