人工感染沙门菌牦牛脾中相关差异表达基因筛选

来源：畜牧兽医学报杂志2018年第4期北京时间：

作者：陈通, 朱育星, 蔡雯祎, 杨琦玥, 邓志和, 兰道亮

单位：1. 西南民族大学 生命科学与技术学院, 成都 610041;2. 西南民族大学 青藏高原研究院, 成都 610041

摘要：旨在从基因组转录水平解析牦牛抗沙门菌感染相关免疫基因及其调控网络。以牦牛沙门菌为模式病原体，以牦牛为研究对象，在12、24、48 h三个不同时间段利用RNA-Seq测序技术对感染牦牛的外周免疫器官脾进行转录组测序。通过比较分析三个时间段感染牦牛和健康牦牛转录组数据，筛选出差异基因，然后对这些差异基因进行GO、KEGG功能分析，并进行共表达网络分析。结果共筛选出413个差异基因，其中185个表现为上调，228个表现为下调，GO分析显示，与生物过程相关的类别比例最大，其中最为富集的是细胞过程、代谢过程、生物调节、生物过程的调控及单一有机体过程。KEGG分析显示，各时间段富集前20的通路中，与感染、免疫相关的通路占有较大比例，这些通路涉及的差异基因主要为趋化因子。WGCNA分析显示，处于网络枢纽的基因共66个，处于网络中心的基因是SCOC和NOCT。本研究在组学层面上探讨了牦牛脾细胞与沙门菌的分子互作机制。

关键词：

基金资助：四川省青年科技基金项目（2014JQ0043）；西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金（2015NZYTD01）